Le massif jurassien s’étend sur trois départements que sont le Doubs, le Jura et l’Ain. Le massif montagneux se dessine en paliers que l’on nomme premier plateau (alt. 500-600m), second plateau (alt. 800-900m) et Haute Chaîne (au dessus de 1200m) couramment appelée « Les Monts Jura ». Le Crêt de la neige culmine à 1720 m d’altitude. La forêt subsiste pratiquement jusqu’aux plus hauts sommets, seuls quelques crêts de la haute chaîne sont dénudés.
Le Jura est composé en majorité de roches calcaires perméables, favorisant l’infiltration de l’eau et donc la dissolution des carbonates. Cette réaction conduit à ce que l’on appelle le karst. Les paysages karstiques sont caractérisés par des formes très escarpées comme les reculées ou les combes, dépressions locales creusées en altitude. Ce processus se traduit en surface par la présence de lapiaz, dalle compacte profondément crevassée.
Le paysage du Jura est fortement marqué par la forêt (environ 60% de la surface) et la tradition sylvicole, ancrée depuis plusieurs siècles. Sur le second plateau, se trouvent des hêtraies sapinières, qui laissent place à la pessière au dessus de 1200m. Ces forêts sont généralement traitées en futaie jardinée, assurant aux propriétaires des revenus réguliers. Cette structure, totalement artificielle, est le fruit d’une gestion sylvicole « pied à pied ».
